Perseus

Общая модель данных (The Observational Medical Outcomes Partnership Common Data Model, OMOP CDM) позволяет проводить систематический анализ разрозненных баз данных медицинских наблюдений. При этом данные из разных источников приводятся к единому представлению — модель данных, терминология, словари, схемы кодирования. Преобразование данных в формат OMOP CDM состоит из нескольких этапов, трудоёмко и требует привлечения программистов.

Perseus решает данную проблему: он является малокодовым (low-code) инструментом для конвертации данных в OMOP CDM. Пользователи работают в гибкой, интуитивно понятной визуальной среде и могут сделать все нужные преобразования данных быстро и без привлечения разработчиков

КАК ЭТО РАБОТАЕТ

 

Преимущества

Наглядность

Интуитивно понятный графический интерфейс.
Процесс конвертации можно наблюдать в режиме реального времени, при этом можно быстро реагировать на возникающие ошибки.
Можно посмотреть отчёты и статусы для каждой конвертации.

Повторное использование

Автоматическое сопоставление (маппинг) одинаковых полей данных — пользователю не нужно каждый раз начинать «с нуля».
Автогенерация значений для полей CDM.
Встроенные словари для маппинга между системами кодирования и стандартными понятиями OHDSI словаря.

Надёжность

Проверка качества данных — использует систематический подход к проверке качества данных.
Интеграция с инструментами, используемыми в сообществе OHDSI (Observational Health Data Sciences and Informatics), в т.ч. White Rabbit, Rabbit-in-a-Hat, Usagi, Athena и Data Quality Dashboard.

Эффективность

Уменьшение затрат на ручную обработку данных.
Perseus включает в себя инструменты для всех этапов преобразования в OMOP CDM.
Количество задействованных специалистов меньше, чем в традиционных проектах конвертации.

ПРОЦЕСС

Предварительная обработка

Предварительная обработка
импорт данных (поддержка репортов White Rabbit или сканирование базы данных напрямую),
объединение исходных таблиц,
обзор информации о таблицах, полях и частотных распределениях значений.

Преобразование данных

Преобразование данных
маппинг исходных данных с таблицами и полями CDM,
сохранение и загрузка ранее сохранённых маппингов,
работа со словарём OHDSI (поиск, добавление новых словарей),
маппинг между системами кодирования и стандартными понятиями cловаря OHDSI,
обработка и очистка исходных данных,
встроенные алгоритмы для группировки и объединения данных,
генерация ETL-спецификаций в разных форматах (Word, HTML, MD).

Процесс конвертации

Процесс конвертации
конвертация данных в CDM формат,
просмотр хода выполнения конвертации,
просмотр результатов конвертации,
экспорт результатов для дальнейшего анализа.

Запросить демо

Мы будем рады показать вам Perseus в действии! Заполните форму, и наш эксперт свяжется с вами, чтобы назначить дату и время демонстрации продукта.